Museum Batik menempati duabangunan. Bangunan pertama berisi koleksi kain, selendang, semekan(kain kemben), destar (kain penutup kepla/blankon), surjan(baju atasan), dan lonthong (semacam ikat pinggang berukuran besar)milik keluarga kerajaan. Sebagian besar koleksi batik di museum ini, bermotifparang. Konon, motif batik parang merupakan motif khas keluuarga KeratonYogyakarta. Museum ini juga menyimpan busana harian Sultan Hamengkubuwana IXyang bermotif Parang Rusak Cohong dan destar motif Parang Kestubo.